Nordhavn Station er en S-togs-station på Østerbro i København. Stationen ligger som en højbanestation på kanten mellem Østerbro og havnen.

Nordhavn Station blev taget i brug 15. maj 1934, samtidig med S-togs-strækningen gennem Boulevardbanen (den delvis nedgravede bane mellem København H og Østerport, også kaldet "Røret"). Nordhavn Station lå på den anden S-togs-strækning der åbnede, fra Hellerup til København H, kun halvanden måned efter den første strækning åbnede.